面由董书恒担任总司令，刘大海担任副总司令。这次任命之后，刘大海将在水师中抽调军官并且去沿海民兵中招募水兵，筹建南洋水师。
彭玉麟以副总参谋长的身份兼任长江水师的司令。
张强依然担任运河水师司令，不过今后运河水师的的活动范围将转移到山东境内的运河段。
马连奎担任太湖水师司令，在太湖西山岛上建设一个水军基地，这个驻地将驻守水师陆战队的一个团，辐射太湖沿岸地区。
最后，是建立两个军校，原来的陆军学堂在原址扩建为高邮陆军军官学校。
另外，在海洲成立一个海军军官学校，趁着现在还没有跟英法闹翻，从英法聘用海军教习，培养专业的海军军官。
董书恒不觉得向自己的敌人学习有什么不好。即使这个老师本性是坏的，只要他的知识是真的，就值得我们去学习，因为知识本身有没有善恶之分。
通过这次扩军，淮海军陆军野战部队将达到近四万人，这还不包括太行纵队。海军将拥有三个内河水师、一个远洋水师。
其实，董书恒也知道这么快速地扩军会影响到军队的战斗力，军官的能力也跟不上。
所以他要求即使是师级军官也要定期地参加军校学习。当然高级军官要学习的知识更多更广。
董书恒认为一个好的高级军官不仅要懂军事还要懂战略、懂政治。
有空的时候他也会给高级军官们上战略课、上国际形势课。军官们还要去学习国际政治、历史，研习国内外的经典战例。
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